Với hình thức là một công ty cổ phần , Công ty cổ phần Vật tư nông nghiệp Thái Nguyên được tổ chức tương đối chặt chẽ và quy mô bao gồm: Đại hội đồng cổ đông, Hội đồng quản trị, Ban kiểm soát, Tổng Giám đốc, Phó tổng giám đốc và các phòng ban liên quan.
- Đại hội đồng cổ đông là cơ quan quyết định cao nhất của công ty, thường họp mỗi năm một lần.
- Hội đồng quản trị (HĐQT) là cơ quan có toàn quyền nhân danh công ty để quyết định, thực hiện các quyền và nghĩa vụ của công ty không thuộc thẩm quyền của Đại hội đồng cổ đông, HĐQT Công ty gồm có 5 thành viên được phân công cụ thể như sau:
+ Ông Đỗ Xuân Hiền - Chủ tịch HĐQT-Phụ trách chung các hoạt động của HĐQT và các nhiệm vụ theo quy định tại Điều lệ Công ty và phân công nhiệm vụ của HĐQT.
+ Ông Trần Văn Thụ - Phó chủ tịch HĐQT kiêm Tổng giám đốc điều hành kiêm người đại diện pháp luật của Công ty: có trách nhiệm thực hiện các nhiệm vụ của Tổng giám đốc, Người đại diện pháp luật của Công ty và các nhiệm vụ khác được quy định trong điều lệ Công ty và quyết định phân công nhiệm vụ của HĐQT.
+ Ông Chu Huy Túc - Phó chủ tịch Thường trực HĐQT kiêm Phó tổng giám đốc phụ trách kế toán thay Kế toán trưởng: có trách nhiệm thực hiện các nhiệm vụ theo quy định tại điều lệ Công ty, phân công của HĐQT và phân công của Thường trực HĐQT; các nhiệm vụ của Kế toán trưởng công ty.
+ Ông Nguyễn Như Quyện- Thành viên HĐQT kiêm Phó tổng giám đốc Công ty: có trách nhiệm thực hiện các nhiệm vụ theo quy định tại điều lệ Công ty, phân công của HĐQT.
+ Ông Phạm Văn Hoà - Thành viên HĐQT: có trách nhiệm thực hiện các nhiệm vụ theo quy định tại điều lệ Công ty, phân công của HĐQT.
- Thường trực HĐQT: Là cơ quan có thẩm quyền giải quyết các công việc theo phân cấp của HĐQT Công ty.
- Ban tổng giám đốc Công ty gồm có Tổng giám đốc và các Phó tổng giám đốc.
+ Tổng giám đốc Công ty là ông Trần Văn Thụ cũng đồng thời là Người đại diện theo pháp luật của Công ty, chức năng nhiệm vụ được quy định trong Điều lệ, Quy chế tổ chức hoạt động của Công ty
+ Các Phó Tổng Giám đốc gồm các ông Chu Huy Túc, Ngô Văn Mai, ông Lê Ngọc Bắc, Nguyễn Như Quyện, và Phạm Thanh Hùng là người điều hành trực tiếp các mảng công việc được Tổng giám đốc phân công và ủy quyền; hỗ trợ Tổng giám đốc trong một số công việc kinh doanh của công ty; điều hành doanh nghiêp thay TGĐ khi TGĐ đi vắng hoặc được ủy quyền.
- Phụ trách kế toán thay Kế toán trưởng là ông Chu Huy Túc.có quyền hạn và trách nhiệm như sau:
+ Tham mưu giúp TGĐ Công ty thực hiên nhiệm vụ mà HĐQT giao theo quy định của Điều lệ Công ty.
+ Kiểm tra giám sát việc chấp hành các chính sách kinh tế tài chính và chế độ kế toán trong doanh nghiệp.
+ Có nhiệm vụ tổ chức lãnh đạo bộ phận kế toán thống kê trong doanh nghiệp thực hiện tốt các hoạt động tài chính của Công ty theo luật định.
+ Tổng hợp, phân tích tình hình kinh tế tài chính trong Công ty một cách thường xuyên đảm bảo phục vụ cho công tác điều hành của TGĐ, đồng thời xây dựng các quy định về quản lý tài chính trong doanh nghiệp trình HĐQT hoặc TGĐ ban hành.
- Văn phòng Công ty có 4 phòng ban và 8 Tổ kinh doanh, các bộ phận này có nhiệm vụ hợp tác, hỗ trợ lẫn nhau. Nhìn chung cơ cấu tổ chức này khá phù hợp với quy mô và đặc điểm kinh doanh hiện nay của công ty.
+ Phòng tổ chức hành chính: Có chức năng tham mưu và giúp lãnh đạo thực hiện công tác tổ chức, cán bộ, bảo vệ chính trị nội bộ, đảm nhiệm công tác hành chính – tổng hợp, văn thư - lưu trữ, phụ trách công tác thi đua, khen thưởng, kỷ luật. Thực hiện công tác thanh tra, kiểm tra, giám sát, pháp chế theo quy định hiện hành.
+ Phòng kế hoạch: Có chức năng tham mưu, giúp việc cho Tổng Giám đốc về công tác kế hoạch sản xuất kinh doanh cũng như triển khai thực hiện kế hoạch đã được TGĐ Công ty phê duyệt; tham mưu phối hợp trong việc kiểm tra về lĩnh vực tiếp nhận và cung ứng hàng hoá theo quy định của nhà sản xuất,
+ Phòng Thị trường: Tham mưu cho TGĐ Công ty về kế hoạch bán hàng và công tác truyền thông của Công ty; tổ chức triển khai thực hiện kế hoạch bán hàng, công tác truyền thông, quảng bá hoạt động kinh doanh của công ty đã được phê duyệt.
+ Phòng kế toán tài vụ: Có chức năng tham mưu cho Hội đồng quản trị và Tổng Giám đốc công ty trong lĩnh vực tài chính - kế toán - thống kê và tín dụng của công ty. Kiểm soát bằng đồng tiền các hoạt động kinh tế trong công ty theo các quy định về quản lý kinh tế của Nhà nước và của công ty, quản lý chi phí của công ty, thực hiện công tác thanh tra tài chính các đơn vị trực thuộc công ty…
- Các đơn vị trực thuộc công ty gồm 9 Chi nhánh trực thuộc và các công ty cổ phần thành viên.
+ Các Chi nhánh vật tư nông nghiệp có trụ sở tại các huyện, thành, thị: Có nhiệm vụ tiếp nhận và tổ chức bán lẻ phân bón, giống cây lương thực, thuốc bảo vệ thực vật phục vụ nông nghiệp và phát triển nông thôn trên địa bàn theo kế hoạch hàng năm công ty giao; Có trụ sở và có con dấu riêng, được mở tài khoản tại ngân hàng, được vay vốn kinh doanh theo ủy quyền và phân cấp của Công ty; Hoạt động theo Luật và điều lệ công ty, tự chịu trách nhiệm về kết quả kinh doanh của đơn vị mình. Bộ máy của Chi nhánh gồm Giám đốc, Phó giám đốc, Kế toán chính và các nhân viên.
+ Các Công ty cổ phần thành viên có trụ sở và có con dấu riêng, đươc mở tài khoản tại ngân hàng; Hoạt động theo Luật, điều lệ của Công ty đó và điều lệ Công ty mẹ, tự chịu trách nhiệm về kết quả kinh doanh của đơn vị mình. Bộ máy của Công ty cổ phần thành viên theo quy định của pháp luật bao gồm Đại hội đồng cổ đông; Hội đồng quản trị; Giám đốc, Phó Giám đốc; Kế toán trưởng và các nhân viên.